Η Μονάδα Έρευνας Γάλακτος χρησιμοποιεί προχωρημένες μεθόδους για το φαινοτυπικό (BIOLOG Phenotype Microarrays), συμπεριλαμβανομένου της εξέτασης της ευαισθησίας τους στα αντιβιοτικά (Sensititre MIC) και γονοτυπικό χαρακτηρισμό (μέθοδοι που βασίζονται στην αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης, αλληλουχία 16S και αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος) των απομονωθέντων μικροβίων. Ο χαρακτηρισμός των στελεχών είναι απαραίτητος για την αντιμετώπιση συγκεκριμένων νοσημάτων στα παραγωγικά ζώα (π.χ. παθογόνα που προκαλούν μαστίτιδα), την επίλυση προβλημάτων που σχετίζονται με επίμονα παθογόνα ή αλλοιογόνα στελέχη εντός των εγκαταστάσεων των τροφίμων, όπως και για τη βελτίωση των προγραμμάτων επαλήθευσης που εφαρμόζουν οι βιομηχανίες τροφίμων.
Η Μονάδα Έρευνας Γάλακτος μπορεί να βοηθήσει στην ανάπτυξη και εγκατάσταση ενός Σχεδίου Δειγματοληψίας και Επιτήρησης του Περιβάλλοντος Επεξεργασίας Τροφίμων ο οποίος αποτελεί έναν καινοτόμο τρόπο για την αντιμετώπιση των αναδυόμενων προβλημάτων:
Η Μονάδα Έρευνας Γάλακτος διαθέτει το προσωπικό και την εμπειρία για την εκπόνηση ειδικών μελετών (projects) προσαρμοσμένα στις ανάγκες των ενδιαφερομένων για την αντιμετώπιση και επίλυση προβλημάτων ή την ανάπτυξη νέων προϊόντων και υπηρεσιών, όπως είναι για παράδειγμα οι μελέτες προσδιορισμού του χρόνου εμπορίας των τροφίμων (shelf-life studies), οι μελέτες εκτίμησης της ανάπτυξης παθογόνων μικροοργανισμών στα τρόφιμα (challenge tests), ο στατιστικός έλεγχος διεργασιών (statistical process control), η διαχείριση κοπαδιού, μελέτες περιβαλλοντικής διαχείρισης και αειφόρου ανάπτυξης (Life Cycle Assessment) βάσει ISO 14040/14044 κτηνοτροφικών εκμεταλλεύσεων και επιχειρήσεων τροφίμων, κ.ά.